La transplantation de microbiote fécal: la solution à bien des problèmes!

Depuis le début de mon blogue en 2017, mon but a toujours été le même: vous permettre de faire de meilleurs choix pour votre chien et vous éduquer afin que le pouvoir de faire ces meilleurs choix vous appartienne. Je suis en général très fier d’avoir (par mes articles) participé à améliorer les produits qu’on vous offre en magasin. Lorsque je regarde une boutique pour animaux aujourd’hui, je vois beaucoup plus de bons produits qu’il y a 10 ans. Que ce soit dans les nourritures (sous toutes ses formes), les gâteries ou les suppléments, vos chiens mangent mieux et ceci leur donne assurément une meilleure santé et des années de plus avec vous.

Cela dit, une chose me choque encore: le milieu vétérinaire continue d’essayer de contrôler les symptômes au lieu de chercher à régler la cause des problèmes. Ceci m’apporte donc à vouloir vous outiller en vous informant sur la plus grande découverte que j’ai fait dans les 10 dernières années. En fait, je crois que je n’ai pas été excité par un produit depuis la découverte de la nourriture lyophilisée! Cet article portera donc sur la TMF ou de son nom complet: la Transplantation de Microbiote Fécal.

Wow, tout un terme…et je vous vois déjà avoir un peu de dégout pour le mot “fécal”! Ne vous en faites pas, ça semble bien complexe comme procédé mais en réalité, vous n’avez besoin de l’aide de personne (même pas votre vétérinaire) pour offrir à votre chien le plus beau cadeau possible pour optimiser sa santé.

En version courte: on prend la colonie de bonnes bactéries d’un donneur en top santé, on met ça dans une capsule (par lyophilisation), tu donnes ça pendant un mois à ton chien et voilà: tu viens probablement de régler une bonne partie de ses problèmes de santé! Ça vous semble trop beau pour être vrai? Je vous met au défi de l’essayer et je vais vous dire plus loin quel produit exact je recommande.

Pour ceux comme moi qui aiment comprendre, voici la version longue:

Le microbiote, c’est quoi ça?

Le microbiote désigne (chez l’humain ou le chien) l’ensemble des micro-organismes vivant dans un environnement donné. Il existe donc par exemple un microbiote intestinal, cutané, vaginal et buccal. Le microbiote est composé de:

  • bactéries (+ 90%)
  • virus
  • champignons
  • archées (micro-organismes)
  • protozoaires (micro-organismes)

Dans le cas qui nous occupe chez le chien, c’est du microbiote intestinal dont je vais vous parler aujourd’hui. Vous avez probablement déjà entendu le terme flore intestinale? C’est la même chose, sauf que flore est scientifiquement incorrect puisque le terme provient de la botanique. Or, dans l’intestin il n’y a pas de plantes. Microbiote reflète donc mieux la réalité mais si vous préférez gardez ça simple, libre à vous de vous dire flore intestinale chaque fois que je cite microbiote.

Le microbiote pour le chien, est-ce si important?

Avez-vous déjà entendu la phrase suivante: 80% de la santé provient de l’intestin? Bien que ce ne soit pas tout à fait scientifique, c’est une image simple pour vous démontrer l’importance de la santé de l’intestin, que ce soit pour l’humain ou le chien.

Voici pourquoi pourquoi l’intestin joue un rôle si important:

  • Il est composé de milliers d’espèces microbiennes;
  • Plusieurs de ces espèces ne peuvent même pas être cultivées en laboratoire. Si votre chien en manque, aucune médication ou supplément ne pourra y pallier;
  • Le rôle de ces microbes est primordial pour l’immunité, le métabolisme et le cerveau.

Réglons tout de suite une chose: lorsque je parle de microbes, ne voyez pas ça comme quelque chose de négatif. En fait, moins de 1% des microbes sont mauvais (pathogènes). Les microbes au sein du microbiote jouent plusieurs rôles:

  • Digestion des nutriments
  • Production de molécules utiles, comme les vitamines et minéraux
  • Protection contre des bactéries pathogènes (mauvaises bactéries)
  • Production d’hormones
  • Régulation du système immunitaire
  • Influence sur le métabolisme et l’humeur (l’intestin est directement lié au cerveau)

Ce qui serait donc plus juste de dire serait que “environ 80% des cellules immunitaires du corps se trouvent dans le tissu lymphoïde intestinal (GALT en anglais pour: Gut Associated Lymphoid Tissue), qui lui fait partie de l’environnement total qu’on nomme microbiote. Vous comprenez donc que nous avons tout intérêt à le conserver en bon état de fonctionnement…et c’est souvent de là qu’origine les problèmes de santé des chiens.

La communauté de microbes dans le corps du chien est en constante évolution; certaines populations vont diminuer, d’autres vont augmenter et c’est complètement normal. Ce qu’on souhaite éviter par contre, c’est un débalancement majeur où les mauvaises bactéries vont surpasser les bonnes bactéries. C’est là que votre chien développera divers problèmes de santé. Nous verrons plus loin les maladies associées à un microbiote débalancé.

La transplantation de microbiote fécal (TMF) c’est donc un procédé qui a pour but de réintroduire (transplanter) un microbiote provenant d’un donneur sain (en bonne santé) vers un chien dont le microbiote est gravement perturbé (malade).

Qu’est-ce qui fait qu’un animal aura un microbiote diversifié et en santé?

Chaque microbiote est unique, comme une empreinte digitale du système digestif.

Ce qui l’influence sera, en ordre d’importance:

  • Alimentation
  • Antibiotiques (de loin les plus dommageables pour le microbiote après l’alimentation)
  • Environnement de vie
  • Autre médication
  • Pesticides (ex: produits antiparasitaires)
  • Vaccination
  • Stress
  • Âge
  • Génétique

Intéressant: Deux chiens de races différentes mais vivant dans la même maison et mangeant la même nourriture auront des microbiotes plus similaires que deux chiens de la même race vivant dans des environnements différents! Certaines études ont même prouvées que les chiens vivant avec des humaines partagent une partie de leur microbiote avec leur propriétaire, parfois même plus qu’avec d’autres chiens. Ceci illustre bien à quel point l’environnement influence grandement le microbiote.

Chaque fois que votre chien vous lèche, c’est un petit partage de microbiote que vous faites!

Lorsqu’un microbiote est problématique, il peut avoir un ou plusieurs problèmes parmi:

  1. Mauvaises proportions entre les bonnes et mauvaises bactéries
  2. Bactéries essentielles manquantes

Surprenamment, la génétique jouera aussi un rôle dans la qualité du microbiote mais beaucoup moins que l’environnement, les antibiotiques et l’alimentation. Cela dit, certaines races présenteront tout de même une prédisposition à avoir des troubles digestifs:

  • Berger allemand: plus suceptible à certaines dysbioses et maladies intestinales
  • Boxer: prédisposition à certaines colites
  • Bouledogue (français/anglais): microbiote souvent moins diversifié (car + 80% naissent par césariennes)

Pourquoi la diète joue un rôle si important dans la richesse du microbiote?

Je ne le dirai jamais assez: la nourriture est le carburant qu’on met dans notre corps. Pensez-vous vraiment qu’en donnant à votre chien une nourriture qui peut passer des semaines/mois sans réfrigération, contenant si peu de viande tout en étant ultra transformée (croquettes), ce serait sans conséquence pour son corps? Je vous explique:

La nourriture que mange votre chien est décomposée par les enzymes digestifs et les bactéries présentes dans son système digestif. Certaines bactéries ont pour tâche de décomposer les protéines, d’autres s’occupent des fibres et d’autres sont spécialisées dans la décomposition des glucides. Lorsque les bactéries du système digestif décomposent des nutriments (protéines, fibres, glucides), elles produisent des molécules qui pourront être réutilisées par d’autres cellules dans le corps. Certaines de ces molécules sont bénéfiques alors que d’autres peuvent mener à des problèmes de santé.

La meilleure diète est celle qui procure des nutriments aux microorganismes qui produisent de bonnes molécules. Vous donnez de bons ingrédients; ça nourri les bons micro-organismes. Vous donnez du McDo? Ca va alors nourrir les mauvais micro-organismes (les petits “bums” du quartier). Les recherches ont prouvées que les chiens bénéficient d’une diète haute en protéines et en fibres mais faible en glucides.

Voici à titre d’exemple la différence d’analyse de microbiote entre un chat de 13 ans nourri au cru (beaucoup de couleurs = belle variété donc meilleure santé) et un chat de 6 mois nourri aux croquettes (peu de couleurs = moins bonne santé):

L’autre point intéressant de cette comparaison est que tel que mentionné plus tôt, normalement en vieillissant le microbiote devrait s’appauvrir en terme de variété (facteur lié à l’âge) alors qu’un jeune animal (6 mois dans notre exemple) devrait avoir un microbiote plus varié vu sa jeunesse. Ceci démontre donc bien l’impact de la nutrition sur la variété du microbiote et ce tout au long de la vie d’un animal.

Le gros problème des croquettes est leur haute teneur en glucides. Trop de glucides causera une surpopulation d’un groupe de bactéries qui s’appelle les Firmicutes. Elles composent souvent 45 à 60% du microbiote intestinal et causeront une surpopulation de mauvaises bactéries dans l’intestin, menant à des problèmes digestifs ou autres.

L’autre groupe de bactéries dont on entendra souvent parler sont les Bacteroidetes, qui elles proviennent surtout de la digestion des protéines et des graisses animales. Elles composent généralement 20 à 35% du microbiote intestinal du chien.

Intéressant: certaines études chez l’humain avancent qu’un débalancement entre les Firmicutes et les Bacteroidetes aurait un lien avec l’obésité. Les humains avec plus de Firmicutes seraient plus obèses. Que mangent la majorité des chiens en surpoids? Des croquettes…riches en glucides, donc en Firmicutes. Intéressant, avouons le.

Le 3e groupe de bactéries qu’on retrouvera chez le chien ce sont les Fusobacteria (10 à 25%) dont la responsabilité est aussi lié à la digestion des protéines. La présence chez le chien de ce groupe de bactéries, non présent chez l’humain, est un autre point qui appuie le fait que le chien est carnivore ou omnivore à tendance carnivore. L’humain, un omnivore pur et dur, n’a pas ça lui des Fusobacteria.

Un comparatif humain/chien:

GroupeHumainChien
Firmicutes (glucides)~40–60 %~45–60 %
Bacteroidetes
(protéines et gras animal)
~30–50 %~20–35 %
Fusobacteria (protéines)très rare~10–25 %

Conseils nutritionnels pour un meilleur microbiote (même si vous laissez votre chien aux croquettes):

  1. Utilisez un topper élevé en protéines animales ajouté aux croquettes
  2. Choisissez une croquette plus faible en glucides
  3. Diversifiez les types de fibres que votre chien mange (en variant les croquettes pendant la vie du chien ou en ajoutant des légumes frais en supplément)
  4. Attention à la teneur en glucides des gâteries; c’est parfois là qu’on se fait avoir
  5. Réduisez les portions; nos chiens seraient tous en meilleure santé si on réduisait un peu leurs portions. Moins de portion = moins de glucides = on nourrit moins les mauvaises bactéries. Cessez de penser que vous leur démontrez votre amour en leur donnant “un peu plus” de nourriture. Plus d’exercice et plus de câlins, ça c’est oui par contre!

Pourquoi les antibiotiques sont si dommageables pour le microbiote?

En plus de l’alimentation, l’autre élément principal qui détruit le microbiote de votre chien est l’utilisation d’antibiotiques. Ceux-ci sont largement (trop?) utilisés par les vétérinaires pour combattre les infections mais ceci vient avec une conséquence directe: la destruction du microbiote.

Quelques noms connus d’antibiotiques utilisés en médecine vétérinaire:

  • Metronidazole
  • Amoxicilline
  • Doxycycline
  • Clindamycine
  • Enrofloxacine
  • Azithromycine

Les antibiotiques agissent en détruisant les bactéries qui causent les infections. Le problème est que l’antibiotique détruit aussi les bonnes bactéries présentes dans l’intestin car il ne fait pas de différence entre ce qui est bon ou mauvais; il ouvre le feu sur tout ce qui bouge. C’est pour cette raison qu’en vieillissant, à mesure que votre chien aura un petit problème ici, un autre quelques années plus tard, etc…et qu’on traitera ces problèmes avec des antibiotiques, on se retrouvera avec des chiens dont le microbiote sera rendu très pauvre et peu varié à mesure qu’ils avancent en âge. Un seul traitement d’antibiotiques aura des conséquences sur le microbiote pendant plus d’un an. Imaginez donc le chien qui prend plusieurs traitements par année…

Encore plus inquiétant: les mauvaises bactéries qui ne seront pas détruites par un traitement d’antibiotiques vont se multiplier et répandre leurs gênes résistants dans l’animal ce qui réduira l’efficacité des antibiotiques d’un traitement à l’autre, nécessitant des doses plus fortes et/ou des traitements encore plus longs. C’est le phénomène qu’on appelle la résistance antimicrobienne et ceci existe autant chez le chien que l’humain.

Depuis 10-15 ans, le milieu vétérinaire commence à prendre conscience de ces conséquences mais il y a encore beaucoup trop de:

  • Traitement “par précaution” (sans avoir la certitude du besoin)
  • Manque de tests diagnostics (culture bactérienne)
  • Pression des propriétaires d’animaux; notre chien ne va pas bien = on veut une pilule
  • Facilité d’accès aux antibiotiques; le médicament coûte souvent moins cher que faire le test…mais ce n’est pas sans conséquences!

Quoi faire si je n’ai pas le choix de donner des antibiotiques à mon chien?

Si votre chien doit recevoir des antibiotiques, je recommanderais fortement de lui donner en même temps une levure en supplément qui s’appelle Saccharomyces boulardii (souvent réduit à S. Boulardii). Vu qu’il s’agit d’une levure (champignon) et non d’une bactérie, elle peut être donnée en même temps que l’antibiotique car ce dernier n’aura pas d’effet sur elle. S. Boulardii va donc aider à plusieurs points:

  • Stabilisation du microbiote
  • Protection contre certaines bactéries pathogènes (mauvaises bactéries); en bloquant la croissance de certaines bactéries nuisibles et en réduisant leur adhérence à la muqueuse intestinale.
  • Production de molécules bénéfiques; en favorisant une meilleure fonction de la barrière intestinale et en produisant des acides gras bénéfiques.
  • Réduction de l’inflammation intestinale
  • Réduction de la diarrhée associée aux antibiotiques

Il existe plusieurs bons suppléments de S. Boulardii mais en voici un que j’aime bien:

Quels problèmes chez le chien peuvent bénéficier d’une TMF?

Lorsque des gens me consultent pour des problèmes avec leur chien depuis maintenant près de 10 ans, j’entends pratiquement toujours les 4 mêmes problèmes:

  • Diarrhée (chronique ou épisodique) ou vomissements
  • Allergies: alimentaires et/ou environnementales
  • Intolérances alimentaires
  • Démangeaisons et/ou léchage excessif

Ce qui me choque le plus, c’est la façon dont le milieu vétérinaire traite ces problèmes: en prescrivant de la médication pour camoufler les symptômes uniquement. Comme si traiter la CAUSE leur était impossible (ou pas assez rentable?).

  • Votre chien est en diarrhée? On prescrit du metronidazole. Ca stoppe la diarrhée…mais ne règle rien.
  • Votre chien se gratte? On prescrit de l’Apoquel ou Cytopoint. Le chien va moins se gratter…mais n’arrêtez jamais la médication! Vous venez de remporter un abonnement à vie.
  • Votre chien ne supporte aucune nourriture? On va lui prescrire une nourriture tellement morte qu’aucun corps ne peut réagir à ces ingrédients. Mais est-ce nutritif? Au final, on vous fait croire que votre chien est “malchanceux” et qu’il ne peut rien manger alors qu’en réalité c’est son corps qui est déréglé.

Tout ceci ne fait pas de sens pour moi. Mais il faut se l’avouer, ça ressemble aussi beaucoup à la médecine humaine, bien que je considère que la médecine humaine va creuser un peu plus pour trouver un diagnostic. Chez votre vétérinaire de quartier, si ça ne se voit pas sur une radiographie et que vous ne voulez pas payer pour aller dans un centre spécialisé, on va se contenter de prescrire une médication pour les symptômes. C’est un peu comme si on ne range pas la maison avant de recevoir de la visite mais qu’on cache tout dans le garage!

Et si on pouvait éviter tout ça simplement en refaisant la santé intestinale (microbiote) de votre chien? Moi je dis que ça vaut le coup d’essayer!

Comment ça fonctionne réellement cette transplantation de microbiote fécal?

Transplantation signifie transfert d’un chien en bonne santé vers un chien avec un problème (ou qu’on souhaite optimiser la santé…car oui on peut le faire AVANT que le chien soit malade). On parlera donc de donneur et receveur.

Pour le donneur, on cherchera évidemment des chiens en super bonne santé, qui mangent une alimentation de qualité, vivent dans un bel environnement, exposés à peu ou pas d’antibiotiques, vaccinés au minimum et ne recevant pas de médication autant que possible. De ces donneurs, les compagnies vont récolter les selles et par un procédé ils vont filtrer (retirer le mauvais) et en extraire tous les bons éléments (la richesse microbienne) pour ensuite encapsuler le tout par lyophilisation. Oui oui, le caca d’un chien en santé pourrait bien être la solution au problème de santé de votre chien. Spécial, je sais!

D’ailleurs, ça pourrait nous amener à penser que les chiens qui font de la coprophagie (manger des selles) pourraient se faire une TMF “naturelle”. La pratique est d’ailleurs observée en nature chez d’autres animaux. Cela dit, je ne suis pas en train de recommander la pratique chez le chien. La différence est que dans les selles, il y a du bon et du mauvais alors que dans la TMF, on ne conserve que le bon.

Viendra ensuite le receveur: votre chien. Pendant 30 jours (la durée d’un traitement recommandé) vous lui donnerez une capsule par jour. Ceci va repeupler son intestin de bons microbes provenant du chien en bonne santé. Un genre de téléchargement de bonne santé intestinale!

En combien de temps je devrais voir une amélioration?

Une des choses les plus surprenantes observées lors d’une TMF est que les résultats se voient rapidement; souvent en 24 à 48 heures, spécialement si les symptômes sont aigus. Ceci peut sembler rapide pour un changement d’écosystème microbien mais plusieurs mécanismes expliquent cette rapidité:

  1. Compétition écologique immédiate: l’intestin est un système très compétitif. Lorsqu’on lui introduit un microbiote sain, les bactéries bénéfiques occupent rapidement toute la place en consommant les nutriments disponibles et en empêchant les mauvaises bactéries de se multiplier. Ce phénomène est appelé l’exclusion compétitive. Les bactéries problématiques (causant les ennuis de santé) vont donc chuter rapidement en nombre, ce qui améliore rapidement les symptômes.
  2. Production rapide de métabolites: les microbes transplantés commencent rapidement à produire des molécules biologiquement actives, comme des acides gras à chaîne courte, des acides biliaires modifiés et des molécules anti-inflammatoires. Ces molécules vont donc améliorer la fonction de la muqueuse intestinale, réduire l’inflammation et normaliser le transit intestinal.
  3. Restauration de la barrière intestinale: un microbiote équilibré aide les cellules à renforcer les jonctions serrées de la barrière intestinale, produire du mucus protecteur et limiter le passage de toxines bactériennes. Pour ceux qui m’ont déjà entendu parler du syndrome de l’intestin perméable (leaky gut), c’est exactement de ça qu’il est question ici. J’aborderai ce point plus en détails ci-bas.
  4. Interaction avec le système immunitaire: le microbiote en bonne santé influence directement l’immunité intestinale. Cela permet donc de calmer rapidement une réaction inflammatoire intestinale (ex: diarrhée).
  5. Modification du métabolisme des acides biliaires: certaines bonnes bactéries intestinales vont transformer les acides biliaires primaires en acides biliaires secondaires, ce qui va aller détruire certaines mauvaises bactéries.

Est-ce que ça fait longtemps que cette technique existe?

La transplantation de microbiote fécal existe en médecine vétérinaire depuis le 17e siècle pour les animaux de la ferme.

Depuis le milieu du 20e siècle, la TMF est aussi utilisée pour le traitement de l’infection à la C. difficile chez les humains. Cette maladie tue encore de nos jours plus de 30000 personnes par année dans le monde. Pourtant, en 2013 une étude frappante pour le milieu médical humain affirmait que 81% des cas de C. difficile étaient guéris par une seule TMF et ce chiffre augmente à 94% si on ajoute un 2e traitement de TMF.

S’en est suivi un intérêt de la médecine vétérinaire pour les chats et les chiens vers les années 2016. C’est donc un procédé relativement nouveau pour les petits animaux (chiens/chats), bien que ce soit utilisé depuis des siècles chez les gros animaux.

Est-ce que le vétérinaire peut faire des TMF lui aussi?

Le vétérinaire peut effectuer des TMF en clinique, mais ça ne se fait pas en capsules. Si vous optez pour cette pratique, je vous invite à questionner en détail les tests effectués sur l’échantillon qui sera utilisé et la qualité du donneur (alimentation, antibiotiques, environnement, etc).

L’autre désavantage de la technique vétérinaire est que la transplantation se fait en une seule fois. Oui, la matière sera insérée directement (souvent par insertion rectale) mais une grande partie de la matière transplantée sera expulsée dès la prochaine selle du chien. Le corps a besoin de temps pour que les bonnes bactéries et microbes se reproduisent et colonisent le receveur.

Pour ces raisons, selon la plus grande experte mondiale sur le sujet (dont je vous parlerai plus loin), les chances de succès sont beaucoup plus faibles (20-30%) avec la technique vétérinaire officielle comparé au produit en capsules (80-90%).

Au final, ce qui importe le plus est en ordre d’importance pour assurer le succès d’une TMF:

  1. La qualité du donneur
  2. La technique utilisée (capsules vs insertion rectale du vétérinaire)
  3. Le support offert à l’organisme pour que la transplantation soit un succès. C’est l’avantage des capsules: on en donne pendant 30 jours à petite dose pour assurer une continuité dans le temps et permettre au corps de s’habituer à ces nouvelles bactéries et d’en recevoir sur une longue période.

C’est bien beau tout ça, mais est-ce que je vais devoir donner ces capsules tout le reste de la vie de mon chien?

Non! C’est ça le plus beau: ça dure dans le temps!

Les études ont prouvées que jusqu’à 40% du microbiote du donneur peut s’implanter durablement chez le receveur après un traitement (une bouteille). C’est comme si une partie du système digestif du chien en bonne santé était réellement transplanté chez votre chien.

La durée des bienfaits dépendra par contre du mode de vie du chien. Si par exemple après le traitement votre chien retourne dans ses vieux patterns de: mauvaise nourriture, antibiotiques tous les jours, produits antiparasitaires, médication par dessus médication, et bien vous allez redétruire les bienfaits de la TMF et ce sera à recommencer.

Cela dit, la majorité des gens vont faire 2 ou 3 traitements de 30 jours par année, question de garder leur chien toujours au sommet de sa santé. D’autres vont préférer donner 2 capsules par semaines tout au long de l’année, sous forme de maintien. Vous feriez donc 4 mois avec une bouteille de 30 capsules. Si ça vous permet de couper complètement sa médication (ou nourriture spéciale) actuelle, je crois que l’investissement en vaut le coup!

Je donne déjà des probiotiques, ce n’est pas sensiblement la même chose?

Oh lala, non…mais je comprends votre réflexion.

Tout d’abord, il faut savoir que beaucoup (trop) de probiotiques sur le marché sont mal conçus, pour diverses raisons:

  • Trop peu de souches différentes (n’oubliez pas, la variété est la clé avec les microbes et bactéries)
  • Pas assez de quantité (millions, milliards, etc) ce qui fera qu’une bonne partie des bactéries des probiotiques sera détruite par l’acidité gastrique du chien.
  • La majorité des probiotiques utilisés chez le chien ne colonisent pas durablement le microbiote intestinal. Plusieurs souches des probiotiques pour chiens proviennent de l’humain ou de produits fermentés et ne sont pas toujours adaptées à l’écosystème intestinal canin.

De plus, beaucoup de gens pensent que les probiotiques vont s’installer dans l’intestin et y rester mais dans la majorité des cas ce n’est pas ce qui se passe (ni chez l’humain ni chez le chien). Les probiotiques vont seulement être de passage dans l’intestin au lieu d’y rester. Les études ont montrées que les bactéries des probiotiques seront présentes dans les selles du chien pendant la prise du supplément mais disparaissent après quelques jours d’arrêt du produit (signe qu’il n’y en a plus de présent). C’est un peu comme faire venir une équipe d’entretien ménager pour votre résidence. Ce sera super propre…mais ça ne va pas durer éternellement. Voilà pourquoi, si on veut donner des probiotiques, il faut en donner sur le long terme. Mais ne serait-il pas mieux que le corps fabrique lui-même la bonne quantité de bactéries, au lieu d’avoir à pallier chaque jour par un supplément? C’est le concept derrière la TMF et pourquoi la TMF est de loin supérieure aux probiotiques. On arrête de se fier sur un supplément à donner chaque jour et on apprend au corps à produire lui-même un environnement optimal.

On pourrait donc dire que les probiotiques transitent dans l’intestin et vont aider temporairement l’écosystème intestinal alors que la TMF va coloniser durablement. Voici un comparatif entre les deux:

ProbiotiquesTMF
Quelques souches bactériennes spécifiquesÉcosystème microbien complet
(pas seulement des bactéries)
Souvent 1 à 10 espècesCentaines d’espèces
Effet souvent transitoireColoniser durablement
(effet durable dans le temps)
Surtout soutien digestifRéinitialisation de l’écosystème intestinal

À qui va bénéficier ce traitement de TMF?

Évidemment, si votre chien démontre des problèmes de santé issus de mon grand top-4, tels que:

  • Diarrhée (chronique ou épisodique) ou vomissements
  • Allergies: alimentaires et/ou environnementales
  • Intolérances alimentaires
  • Démangeaisons et/ou léchage excessif

Son microbiote a clairement besoin d’une TMF maintenant! Les symptômes sont clairs et devraient être interprétés comme une demande d’aide.

Chez d’autres chiens, ce sera plus subtile.

Les recherches ont prouvées qu’en vieillissant, même en bonne santé apparente, les chiens (et chats) vivront une réduction de la présence des bactéries bénéfiques, une augmentation des bactéries qui augmentent l’inflammation et moins de diversité des bactéries en générales (bonnes et mauvaises). Bref, avec le temps, le microbiote s’appauvrit. Chez les souris et les poissons, la TMF de jeunes donneurs vers des receveurs âgés a même augmenté l’espérance de vie.

De plus, certains diagnostics comme la maladie inflammatoire chronique de l’intestin (MICI) ou (synonyme) l’entéropathie inflammatoire chronique (EIC) et leur cousin le syndrome du colon irritable (intestin sensible mais sans inflammation) peuvent grandement bénéficier d’une TMF. En fait, une étude réalisée sur 40 chiens et 72 chats a démontrée qu’en 25 jours, 80% des chiens et 83% des chats ont vu une amélioration de leur condition.

Pour ce qui est des chiens ayant des problèmes de peau (le plus grand organe du corps), tels que: démangeaisons, peau rouge, perte de poil et infections aux oreilles récurrentes, ces problèmes ont une connexion directe au microbiote. La raison est que les problèmes de peau sont souvent une réaction du système immunitaire et la majeure partie des cellules immunitaires du corps se trouvent…dans l’intestin!

De plus, un microbiote en mauvaise santé causera que les parois de l’intestin vont devenir perméable. Dans cette condition, l’intestin ne fait plus correctement son rôle de douanier qui devrait laisser passer uniquement les bonnes choses dans le sang. Lorsque la paroi devient perméable, les toxines peuvent passer librement pour se rendre dans le sang et c’est là que le corps va avoir l’impression de se faire attaquer. Son système de défense va alors se mettre en action et déclencher ce qui nous paraitra comme une réaction allergique: démangeaisons, rougeurs, etc…vous croirez à une allergie alimentaire alors qu’en fait c’est son intestin qui ne fait plus son travail. C’est la maladie selon moi la moins diagnostiquée par nos vétérinaires et pourtant très fréquente: le syndrome de l’intestin perméable, ou leaky gut syndrome en anglais. Ça existe chez l’humain également.

Pendant tout ce temps je croyais mon chien allergique à quelque chose alors que la source du problème proviendrait de son intestin?

Exactement, ce que nous pensons être des allergies chez notre chien est bien (trop) souvent un problème qui origine de l’intestin et prenons le temps de comprendre comment c’est possible:

Nous avons déjà appris que 80% des cellules immunitaires du corps se trouvent dans le tissu lymphoïde intestinal (donc dans l’intestin). La paroi intestinale (muqueuse) est composée de cellules épithéliales bien serrées qui agissent comme des douaniers: elles laissent passer les nutriments pour aller dans le sang et bloque les envahisseurs (mauvaises bactéries) afin que ceux-ci restent dans l’intestin et soient dirigés vers la sortie (les selles). C’est lorsque cette barrière devient compromise (à gauche sur l’image ci-dessous) et que le douanier s’endort sur la job que les problèmes commencent; le syndrome de l’intestin perméable débute. Les “déchets” vont alors passer la barrière de l’intestin pour se rendre dans le sang et en réaction, le corps va alors envoyer son armée le défendre contre cette attaque d’envahisseurs. Le système de défense se nomme le “système immunitaire”.

Le tissu lymphoïde intestinal a aussi pour rôle d’apprendre aux cellules immunitaires quoi attaquer et quoi ignorer. Il surveille constamment la douane sans discrimination en analysant: nourriture, microbes (bons et mauvais) et particules environnementales. Son but est de décider ce qui est sécuritaire et ce qui ne l’est pas. Prenons trois exemples:

  • Protéine de boeuf décomposée en nutriments: excellent, on laisse passer pour aller dans le sang et on en prendrait plus!
  • Gazon: bof, pas nutritif mais pas dangereux donc pas besoin de réagir.
  • Protéine de boeuf non décomposée (qui passe car la douane est grande ouverte dû à l’espace entre les cellules épithéliales): on réagit, ça ne devrait pas être sous cette forme (protéine non décomposée). On sonne l’alarme, déclenche l’inflammation et on appelle l’armée! Sortez-moi ça du corps au plus vite par la peau (le plus grand organe) et souvenez-vous de son apparence pour réagir de la même façon si jamais cet envahisseur revient = votre chien se gratte! Vous le croirez alors devenu “allergique” au boeuf.

Dans un cas de leaky gut, ce système de défense se dérègle et voit de plus en plus de choses comme une menace. Graduellement, il alerte de plus en plus et avec le temps, il passe son temps sur le téléphone à faire sortir l’armée (la réaction immunitaire) pour chaque chose qu’il voit passer. Le système immunitaire réagit et c’est là que votre chien va se mettre à le gratter, se lécher, tomber en diarrhée, etc…car son corps veut le défendre en voulant expulser par tous les moyens possibles ces faux envahisseurs.

Donc pour un chien en santé, le tissu lymphoïde intestinal agit en professionnel: “ça oui” peut passer, “ça non” et il fait toujours les bons choix. Dans un cas de leaky gut, il agit en véritable hystérique en sonnant l’alarme pour tout. C’est ce qu’on appelle une réponse immunitaire excessive. C’est la raison pourquoi les “allergies alimentaires” se développent souvent plus tard dans la vie d’un chien. Votre chien n’est pas devenu soudainement allergique au boeuf. C’est son douanier qui devient un peu sénile. Comment réparer ça? En soignant l’intestin.

Ensuite, il faut aussi parler de l’histamine. Nous sommes souvent porté à voir l’histamine comme un élément négatif. Après tout certains médicaments contre les allergies s’appellent bien des antihistaminiques. Pourtant à doses conformes, le rôle de l’histamine est de régulariser la digestion, la réponse immunitaire et même le fonctionnement du cerveau. Par contre, lorsque le douanier devient sénile, le corps ne se débarrasse plus assez rapidement de l’histamine et se retrouve donc en surdose. Le chien se retrouve alors avec de la peau rouge, démangeaisons, infections aux oreilles, anxiété et de l’hypervigilance (appeler l’armée constamment pour rien).

Mais pourquoi le corps ne réussit pas à se débarrasser assez rapidement de l’histamine? Car il ne produit pas assez de diamine oxydase, l’enzyme responsable d’éliminer l’histamine. Qu’est-ce qui produit la diamine oxydase? Le tissu lymphoïde intestinal. Vous commencez à voir la relation entre réponse immunitaire et intestin? L’intestin laisse passe n’importe quoi, le corps répond excessivement mais ce qui calme cette réponse est normalement produit…par l’intestin qui ne fait plus son travail. Au final, tout est déréglé et le corps de votre chien réagit de façon complètement illogique.

Lorsque l’intestin est envahi par trop de mauvaises bactéries et qu’il manque de diamine oxydase, même des niveaux normaux d’histamine peuvent causer des réactions immunitaires anormales. La TMF va donc venir rétablir la santé de la barrière de l’intestin pour que tout ce beau monde recommence à faire son travail correctement.

Comment on procède pour améliorer la condition de notre chien malade?

Si votre chien vit des symptômes tels que ceux mentionnés précédemment, voici comment je recommande de procéder pour enfin sortir de ce cercle vicieux:

  1. Identifier les déclencheurs: si vous ne connaissez pas les déclencheurs de votre chien, un test comme le Nutriscan pourrait être une bonne idée.
  2. Nourrir l’intestin: optez pour une nouvelle protéine, quelque chose que votre chien n’a jamais mangé. Et avant que vous me le demandiez: non, la diète de protéines hydrolysées du vétérinaire je ne crois pas que ce soit une bonne idée. Pourquoi? Élevé en glucides donc va produire beaucoup de Firmicutes et inflammatoire à cause de ses nombreux ingrédients de remplissage. Visez du frais et le moins transformé possible.
  3. Transplantation de microbiote fécal: c’est là que débute la réelle rémission; en rebâtissant un intestin qui fait son travail correctement. Malheureusement, ça ne se fait pas avec des probiotiques qui seront seulement de passage. Ça prend plus que ça; on veut la communauté microbienne au grand complet qui prenne racine dans l’intestin et surtout, on veut que ça dure dans le temps! C’est un peu comme avoir un ami qui passe en ville pour le weekend (probiotiques) comparé au même ami qui se construit une maison sur votre rue (TMF). Avec la TMF, vous pourrez compter sur lui longtemps!

Important: il est recommandé de stopper de donner des probiotiques pendant que vous donnez la TMF. Le but est d’obtenir une balance de bactéries donc disons que vos probiotiques contiennent de grosses quantités de la bactérie X, continuer les probiotiques pendant la TMF pourrait créer une surcharge de cette bactérie X et défaire la balance qu’on tente de repeupler dans l’intestin.

Une fois la TMF débutée, la nouvelle communauté microbienne va créer des acides gras à chaîne courte pour réduire l’inflammation, réparer la barrière de l’intestin et communiquer avec le tissu lymphoïde intestinal pour refaire l’éducation des cellules et leur réapprendre ce qui est bon et ce qui ne l’est pas. L’histamine va reprendre son rôle modéré (et arrêter de prendre trop de place) et la production de diamine oxydase va recommencer. Ce qui était un enchainement de réactions excessives redeviendra un système immunitaire qui fonctionne normalement. On rebâti sa santé, de l’intérieur et surtout, de la source même qui engendrait les problèmes externes visibles. C’est comme ranger la maison, pour vrai et sans raccourci.

En bref, ce que vous voyez comme symptômes chez votre chien est une conséquence et non le problème en soi. Il se gratte oui mais ce n’est pas un problème de peau. On doit voir plus large que ça.

Tout ça semble intéressant Martin, mais l’as-tu essayé?

Oui, et c’est là que mon intérêt pour le sujet est devenu une véritable passion. J’ai vu mon chien changer du tout au tout. Avec l’âge (12 ans au moment d’écrire ceci), disons que la batterie de mon chien se rechargeait à 45% comparativement à “sa jeunesse”. Je me disais que c’était normal, on devient tous moins actifs avec l’âge…mais je me trompais!

Après un traitement de TMF (un seul mois de capsules), son énergie globale est remontée à 90%. Il est retourné en forme comme s’il avait 4 ans…et le plus beau dans ça: ça dure encore plus de 6 mois après le traitement. Mon chien a toujours bien mangé (j’espère!), a de bons suppléments, un bel environnement sans stress, etc…et il avait une énergie très acceptable pour ses 12 ans. Mais j’avais tord, il pouvait être mieux et depuis la TMF, il retrouve des comportements de jeux que le temps lui avait enlevé. C’est vraiment beau à voir (et me fait sentir un peu coupable de ne pas l’avoir fait plus tôt). Mais je ne suis pas seul. Vous irez lire les critiques sur les produits lorsque je vous les présenterai plus loin.

Alerte aux divulgâcheurs: il existe seulement deux compagnies qui fabriquent des capsules de TMF canin donc le choix est assez simple à faire.

Le mode de fabrication: est-ce uniquement des selles mises dans une capsule?

Non, c’est beaucoup plus complexe que ça!

Les selles en sont la matière première mais le fabricant va filtrer le produit et retirer les fibres (la majeure partie du poids d’une selle) et ce qui est non nécessaire ou bénéfique pour le chien receveur. Au look, vous aurez l’impression de voir une capsule de probiotiques.

Le produit filtré sera ensuite lyophilisé (oui comme la nourriture que votre chien aime tant) et doublement encapsulé dans un enrobage gastro résistant pour bien se rendre à destination (l’intestin donc la capsule doit résister à l’acidité de l’estomac). Pour ceux qui s’inquiètent: non les capsules n’ont pas d’odeur; pour nous du moins.

Comment on le donne aux chiens? De la même façon que vous faites pour une autre médication. Camouflé dans une gâterie serait ma recommandation. La taille de la capsule est ajustée au poids du chien.

Combien ça coûte et on achète ça où?

Deux compagnies se partagent le marché pour les capsules de TMF: Animal Biome et Legacy Biome

Animal biome:

  • Entreprise américaine fondée en 2016 par une microbiologiste (Holly Ganz, PhD)
  • Large échantillon de donneurs (ce que j’aime moins): certains mangent des croquettes, d’autres mangent du cru mais ils disent bien tester toutes leurs matières premières.
  • Offrent un test pour connaitre la richesse (ou pauvreté) du microbiote de votre animal (car c’est possible pour les chats aussi en passant). 135$ US (179$ CAN). Ce test leur a permis d’accumuler la plus grande base de données de microbiote de chiens et chats au monde. C’est excellent pour la recherche mais ça n’améliore pas la santé de votre chien.
  • 2 produits de TMF possibles:
    • Gut Restore: donneurs variés sans garantie sur leur type d’alimentation (125-145$ US (180-200$ CAN) selon la taille de votre chien)
    • Gut Restore from Raw-Fed dogs: donneurs uniquement nourris au cru (165-185$ US (229-249$ CAN) selon la taille de votre chien)
  • Disponible en 3 grosseurs de capsules
  • Ils fabriquent aussi d’autres produits comme des (très bons) probiotiques.

Legacy Biome:

  • Entreprise canadienne fondée par quelqu’un qui travaillait (et travaille encore) en TMF pour humains.
  • Les donneurs proviennent uniquement de la lignée de 7 générations de caniches de la vétérinaire Dre Margo Roman
  • Les chiens donneurs sont nourris au cru, mangent uniquement des légumes bio et boivent de l’eau sans chlore ni fluore
  • N’ont jamais reçu d’antibiotiques ni pesticides (produits anti-parasitaires)
  • Sont traités selon un protocole minimum en termes de vermifuges et vaccination
  • Sont nés vaginalement (la césarienne empêche le transfert d’une partie du microbiote de la mère vers le chiot)
  • Vivent sur un terrain de 7 acres (2,8 hectares)
  • Un seul produit de disponible, en 3 grosseurs de capsules (selon la taille de votre chien)

Sans grande surprise, le produit que je recommande (et que j’ai utilisé): Legacy Biome. Le fait que le produit provienne d’une seule lignée de chiens assure selon moi un produit de haute qualité et surtout, stable d’une bouteille à l’autre.

Le prix pour ce produit: 279$ CAN peu importe le format de votre chien. En fait, on paie surtout pour le procédé de fabrication car il faut bien se l’avouer, la matière première est peu dispendieuse bien qu’en quantité limitée…

Je vous entends trouver ça dispendieux pour une bouteille de 30 capsules…ce à quoi je vous demanderai: “Combien vous a coûté votre dernière visite au vétérinaire”? Disons une visite de routine avec prise de sang, rien d’exceptionnel. Ou une consultation en urgence? Probablement plus cher que 280$!

Qui est Margo Roman?

Vétérinaire depuis plus de 47 ans ayant sa propre clinique en périphérie de Boston depuis 1983, elle se spécialise autour de la transplantation de microbiote fécal. Elle a appris la technique à l’école vétérinaire mais uniquement sur des chevaux, porcs et des bovins. Elle a par la suite adapté la technique pour le chien, qu’elle utilise depuis 2012 dans sa pratique (bien avant l’invention des capsules) et depuis elle est l’experte mondiale sur le sujet.

Dre. Roman est aussi une pionnière de l’acupuncture pour chiens et de l’utilisation d’ozone (une forme très réactive d’oxygène qui pourrait mériter son propre article) en plus de la TMF. Au départ le but de son utilisation de la TMF était de régler des troubles intestinaux, mais elle a alors vu une multitude d’autres problèmes se régler: les problèmes de peau, comportement, reins et pancréas. Bref, elle a été conquise par les résultats au point d’en faire son champ d’expertise. Depuis elle enseigne la technique et donne des conférences dans plusieurs universités partout dans le monde et a effectué plus de 20 000 TMF.

Elle a dépensé plus de 1 million de dollars US (sa retraite!) en frais d’avocats pour défendre le liberté d’expression en lien avec l’alimentation crue et l’utilisation de traitements alternatifs en médecine vétérinaire, se rendant jusqu’en Cour Supreme. Vous voyez donc le genre de femme qu’elle est car évidemment, elle est loin d’avoir tout le milieu vétérinaire de son côté!

Si vous aimez les podcast il y en a une foule où elle est invitée et elle est hyper intéressante à écouter. Ce lien en est un bon exemple, où elle discute de TFM avec un autre vétérinaire légendaire, Dr Ian Billinghurst qui est celui qui a popularisé le concept BARF de nourriture crue dans les années 1990. L’histoire de Titan (un chien de 14 mois que tous les spécialistes voulaient euthanasier) qu’elle raconte à 15:47 est vraiment passionnante et vaut l’écoute si vous avez quelques minutes (et la fin est magnifique).

Pour en revenir au programme principal, avec Legacy Biome, vous obtenez un produit dont les seuls donneurs sont les chiens de Dre Margo Roman. C’est là l’énorme valeur selon moi, qui en justifie largement le prix à mes yeux. Pour avoir vu les résultats sur mon propre chien, je le recommande sans hésiter.

Voici une courte présentation de sa philosophie, ses chiens et du produit de Legacy Biome:

Est-ce que je devrais faire tester le microbiote de mon chien?

Bien que je vous avoue que je trouverais ça intéressant de faire tester un microbiote de chien (malade ou en santé), considérant que le prix du test (179$ CAN) est considérable et se rapproche du prix du traitement (à 100$ près), je recommanderais de traiter directement. De plus, sachant que le traitement n’a aucune contre-indication ou désavantage, je crois que même un chien qui apparait en santé pourra bénéficier de la TMF.

Si vous faites malgré tout tester votre chien (spécialement si vous faites tester avant ET après une TMF), je serais vraiment intéressé à voir les résultats!

Qu’est-ce que je souhaite pour l’avenir?

  1. Les vétérinaires devraient avoir des capsules de TMF en stock, utiliser le produit et le recommander. Je suis le premier à avouer que ce n’est pas normal que ce soit moi qui vous apprenne tout ça.
  2. Les vétérinaires devraient cesser des prescrire des antibiotiques sans avoir épuisé tous les autres moyens de traiter.
  3. Chaque prescription d’antibiotiques devrait venir avec un pot de S. Boulardii pour réduire les effets néfastes des antibiotiques.
  4. Les vétérinaire devraient s’éduquer sur l’utilisation de l’ozone et ses propriétés antibactériennes en complément à l’utilisation de la TMF.
  5. Les clients devraient arrêter de vouloir repartir avec une prescription à chaque fois qu’ils consultent. Ça vous réconforte VOUS mais ça a surtout des conséquences sur la santé de votre chien.
  6. Les clients devraient accepter de pousser plus loin les diagnostics (et les frais qui vont avec) pour inciter le milieu vétérinaire à arrêter de focusser à traiter seulement les symptômes.
  7. Investissez dans la nutrition fraîche de votre chien. Vous économiserez largement l’investissement en frais de vétérinaire.

Conclusion:

Je crois qu’il est temps qu’on arrête de traiter uniquement les symptômes de nos chiens et qu’on s’adresse à trouver la source des problèmes qu’ils ont. Pour ce faire, il faut traiter leur corps comme un tout et peu importe où nous semble être le problème, il y a de bonnes chances que l’origine provienne du système digestif. C’est la tour de contrôle du système immunitaire du corps entier!

La transplantation de microbiote fécal est un moyen qui permet d’optimiser cette tour de contrôle. C’est simple, non invasif, relativement abordable et sécuritaire à faire à la maison. Si votre chien ne va pas bien ou si vous souhaitez optimiser sa santé, vous perdez quoi à l’essayer?

Vraiment, c’est le cas de le dire:

“That’s good shit”!


Bibliographie:

Giving our dogs fecal transplants and how with Dr. Margo Roman – 2023

State of the gut 2024 – Animal Biome 2024

How FMT Can Help Your Dog’s Allergies – 2025

Importance of the Canine Microbiome with Dr. Margo Roman – 2024

Gut microbiota composition may relate to weight loss rate in obese pet dogs – 2017

Clostridium perfringens: A review of enteric diseases in dogs, cats and wild animals – 2015

Prevalence, toxin gene profile, antibiotic resistance, and molecular characterization of Clostridium perfringens from diarrheic and non-diarrheic dogs in Korea – 2018

Effects of the Dietary Protein and Carbohydrate Ratio on Gut Microbiomes in Dogs of Different Body Conditions – 2017

Saccharomyces Boulardii For Dogs: Get The Facts – 2023

Comparison of the Gut Microbiome between Atopic and Healthy Dogs-Preliminary Data – 2022

The Gut Microbiome and Individual-Specific Responses to Diet – 2020

Duodenal Infusion of Donor Feces for Recurrent Clostridium difficile – 2013

Coprophagy prevention alters microbiome, metabolism, neurochemistry, and cognitive behavior in a small mammal – 2020

Fecal Microbiota Transplantation in Animals: Therapeutics, Conservation, and Farming – 2025

The fecal microbiome in dogs with acute diarrhea and idiopathic inflammatory bowel disease – 2012

Systematic review with meta-analysis: Saccharomyces boulardii in the prevention of antibiotic-associated diarrhoea – 2015

Dog Owners’ Attitude toward Veterinary Antibiotic Use and Antibiotic Resistance with a Focus on Canine Diarrhea Management – 2023

The microbiome: an emerging key player in aging and longevity – 2020

Is there a link between aging and microbiome diversity in exceptional mammalian longevity? – 2018

Best Practices for Microbiome Study Design in Companion Animal Research – 2021

Microbiota from young mice counteracts selective age-associated behavioral deficits – 2021

Regulation of life span by the gut microbiota in the short-lived African turquoise killifish – 2017

Allergy Wars: How FMT Ends the Battle and Restores Balance from the Inside Out – 2025

Martin Letendre